眼镜蛇

印度眼镜蛇为什么这么毒多种测序技术揭谜底

发布时间:2022/7/30 14:20:19   
北京白癜风专科医院在线咨询 http://pf.39.net/bdfyy/jdsb/160312/4786432.html

美国和印度的一组研讨人员即日在《NatureGenetics》杂志上发布了印度眼镜蛇(Najanaja)的高原料参考基因组和转录组,这不只能驱策退化研讨,也有助于新式抗蛇毒血清的开辟。

印度眼镜蛇基因组测序和组装的示企图(图片来自原文)

印度眼镜蛇是印度四大毒蛇中的一种,在印度被称为圣蛇。咱们在片子中每每会看到这类眼镜蛇,跟着笛声而翩然起舞。它的毒液是猛烈的神经毒素,会隔离器官与神经系统的联络,致使肌肉麻痹、呼吸枯竭、心搏中止。

研讨人员行使长读长测序、短读长测序、光学图谱、Hi-C做图以及染色体测序等法子,测序并组装了印度眼镜蛇的基因组。他们还同时获得了毒腺及其余十几个器官的RNA序列数据,觉察19种基因在眼镜蛇毒腺中稀奇性抒发,增进了致命毒素的形成。

这项研讨的资深做家SomasekarSeshagiri表示,行使合成的人源化抗体来靶向这些基因所形成的毒素,该成绩希望协助人们开辟出平安灵验的抗蛇毒血清。Seshagiri方今担当印度SciGenom研讨基金会的主席,此前曾就事于Genentech公司。

在这项研讨中,研讨人员行使长读长测序(PacBio和OxfordNanopore)和短读长测序(Illumina)的数据来建设contig,以后连合Chicago染色质互相影响数据来生成scaffold。接下来,他们再连合BioNano光学图谱和Hi-C测序数据来组装印度眼镜蛇的基因组。终究,他们获患有1.79Gb的Nana_v5基因组,scaffoldN50长度为.35Mb。

行使十几个机关的基因抒发数据,他们随后对23,多个展望的卵白编码基因施行了诠释,并判断出实用的渐变和基因家属的扩增。他们还较量了六只印度眼镜蛇的序列,以相识其遗传各类性,并针对来日的药物开辟施行了卵白质组展望。

研讨人员觉得,这些序列数据不只也许供应眼镜蛇退化的线索,再有助于新式抗蛇毒血清的开辟。方今制备抗蛇毒血清的方法是将蛇毒少数屡屡打针到马身上,而后再从马的血液中提掏出抗体。这类血清昂贵且稀缺,在简单遭遇蛇的偏僻区域很少装备。

在剖析了毒腺及其余器官的RNA序列后,研讨人员觉察12,个基因在毒腺中显然抒发,这些组成了毒液组(venom-ome),个中包罗了33个毒素家属的个基因。在这个基因中,有19个基因是毒液组稀奇性毒素(VST),也便是说它们在毒腺中稀奇性抒发。

做家诠释说:“重组毒液卵白可做为抗体噬菌体库的钓饵,以得到中庸毒素的人源化合成抗体。毒腺细胞的原代造就或近来开辟的毒腺类器官造就,与基因组音信相连合,可认为抗蛇毒血清的开辟供应另一种可行的毒液抗正本源。”

除了印度眼镜蛇,印度的其余三大毒蛇离别是锯鳞蝰蛇、印度环蛇和圆斑蝰蛇。另一名做家、新加坡国立大学的ManjunathaKini表示,他们下一步企图得到这三种毒蛇的基因组和毒腺基因。“这将为开辟平安通用的抗蛇毒血清供应一个完好的平台,造福于印度、非洲及其余区域的被咬伤者,”他说。

参考文件:

TheIndiancobrareferencegenomeandtranscriptomeenables

转载请注明:http://www.aideyishus.com/lkcf/1041.html

------分隔线----------------------------

热点文章

  • 没有热点文章

推荐文章

  • 没有推荐文章